Do najbardziej istotnych korzyści używania programu Server Manager należy możliwość sprawnego zarządzania środowiskiem wieloserwerowym poprzez tworzenie harmonogramów i dystrybucję zadań, które program wykonuje automatycznie na kilku serwerach. W ten sposób Server Manager może wyręczać administratora – i ograniczać ryzyko ludzkiego błędu – w następujących operacjach:

• kopiowanie i ładowanie modułów NLM
• modyfikacja parametrów pracy serwerów
• porównywanie, aktualizacja i dystrybucja modułów NLM
• kopiowanie plików i oprogramowania (w tym dystrybucja plików z lokalnego komputera na wiele serwerów i vice versa)
• kasowanie/odzyskiwanie/usuwanie skasowanych plików (cleanup/salvage/purge)
• dystrybucja zmian w plikach tekstowych i konfiguracyjnych
• dystrybucja komend konsoli
• synchronizacja czasu na serwerach
• rozłączanie połączeń

Serwer Manager oferuje wszechstronny mechanizm porównywania i rozpowszechniania ustawień konfiguracyjnych, dzięki czemu możliwe staje się wdrażanie spójnych stanów konfiguracji, wykrywanie błędnych konfiguracji i strojenie dowolnej liczby serwerów. Funkcja ta jest o tyle istotna, że zarządzanie konfiguracją stanowi istotny element procesu identyfikacji problemów na serwerze.

Przykładowo użytkownik programu ma możliwość porównania konfiguracji między kilkoma serwerami (a więc parametrów SET, plików konfiguracji, NLM-ów i ścieżek wyszukiwania) lub w ramach jednego serwera po wprowadzeniu zmian (np. po instalacji nowego oprogramowania lub zmiany w polityce bezpieczeństwa). Funkcja ta okazuje się pomocna w przypadku migracji bądź uaktualnienia, gdy zachodzi potrzeba archiwizacji danych inwentaryzacyjnych. Można wówczas zapisać do pliku o rozszerzeniu XML, HTML lub comma delimited – a także wydrukować – szablon aktualnej konfiguracji serwera bazowego i porównać go z konfiguracją serwera po dokonaniu zmian, a w razie uszkodzeń odtworzyć poprzednie ustawienia. Sporym atutem programu jest opcja dystrybucji parametrów SET z serwera bazowego – lub z uprzednio zapisanego szablonu konfiguracji – na dowolną liczbę serwerów. W rezultacie użytkownicy mogą niewielkim wysiłkiem dostosowywać dowolną ilość serwerów do przyjętych standardów konfiguracyjnych, ograniczając przestoje w sieci, eliminując luki w bezpieczeństwie oraz optymalizując wydajność serwerów.

Server Manager oferuje możliwość nagrywania i odtwarzania sekwencji naciśnięć klawiszy na konsoli serwera oraz tworzenia makr klawiaturowych. W ten sposób administrator może definiować skrypty, które samoczynnie wykonują określone operacje administracyjne na wielu serwerach jednocześnie. Mogą to być np. programy wymagające podania hasła lub ręcznego wykonania innych czynności.